Godrick писал(а):
	 с сабами в контейнере то кодировка верна. 	
	  Вроде текстовые аттачи (сабы) должны быть в UTF-8 или иметь указание иной кодировки, а MKVToolnix кажись автоматом конвертит в UTF-8.  
 По медиакодеру ничего сказать не могу  - т.к. с желаемыми мной настройками она плевалась ошибками, я её почти сразу снёс. 
	Godrick писал(а):
	плагин к MKVtoolnix, чтобы в самой программе была возможность 	
	  Увы, но на выходе только MKV. //хотя MKVextract(GUI) позволяет выдрать составные дорожки. 
	Godrick писал(а):
	Задумал сделать хардсаб для просмотра на кпк/dvd 	
	  Рекомендую также покурить это: 
http://habrahabr.ru/blogs/video_processing/49735/ и AviSynth вообще, ибо его скрипты не только отлично кушаются VirtualDub'ом, но и основа для кодирования в MeGUI.  
Добавлено спустя 4 минуты 59 секунд:  ps увы хоть немного подробно расписывать не могу - сессия, да и кодировать с нашего разговора в ЛС годичной давности толком не приходилось ^_^"